Test Prenatal No Invasivo: conozca el neoBona GenomeWide

El tamizaje prenatal es un proceso esencial en el seguimiento de un embarazo para monitorear la salud de la madre y del bebé, incluyendo la detección de posibles anomalías genéticas fetales. Entre los métodos más avanzados y menos invasivos disponibles hoy, destaca el Test Prenatal No Invasivo (NIPT), que analiza el ADN fetal libre circulante (cfDNA) presente en la sangre materna.  

Este artículo aborda en detalle qué es el NIPT, cómo se realiza y sus principales aplicaciones, proporcionando información valiosa para médicos y profesionales de laboratorio que buscan actualizarse sobre los avances en el área de diagnósticos prenatales. 

Consulta también el artículo completo sobre NIPT aquí en nuestro blog. 

¿Qué es un examen no invasivo?

Las pruebas no invasivas son procedimientos diagnósticos o de detección que permiten la evaluación de condiciones de salud sin la necesidad de penetración física en el cuerpo, evitando riesgos asociados a métodos invasivos como infecciones y complicaciones quirúrgicas. 

Utilizan técnicas como ultrasonografía, resonancia magnética y análisis de muestras biológicas simples, como sangre, orina, saliva, proporcionando un enfoque seguro y eficaz para obtener información sobre la salud o condición del individuo. En el contexto prenatal, las pruebas no invasivas, como el test prenatal no invasivo (NIPT), analizan el cfDNA fetal presente en la sangre materna para identificar principalmente alteraciones cromosómicas.  

El descubrimiento de fragmentos de ADN fetal libre en la sangre materna, junto con el desarrollo de métodos de secuenciación de ADN a gran escala, revolucionaron las opciones para el diagnóstico prenatal (1).  

Previamente, la evaluación del riesgo de anomalías cromosómicas se realizaba mediante un algoritmo que combinaba la medición de proteínas asociadas al embarazo en el suero materno con datos ecográficos, permitiendo estimar el riesgo fetal. Actualmente, el tamizaje con NIPT ha aumentado la sensibilidad y especificidad diagnóstica, reduciendo la tasa de falsos positivos. Como resultado, la selección de pacientes que necesitan someterse a métodos invasivos ha mejorado en comparación con el tamizaje tradicional. 

¿Qué es el test prenatal no invasivo (NIPT)?

El NIPT (non invasive prenatal testing) o test prenatal no invasivo consiste en el análisis de ADN fetal libre circulante (cfDNA), presente en la sangre materna, para la detección de alteraciones cromosómicas fetales, mediante una recolección mínimamente invasiva de punción venosa materna.  

Anteriormente, la detección convencional del primer trimestre (ultrasonografía y biomarcadores séricos) ha permitido   el tamizaje de las alteraciones cromosómicas más frecuentes en el feto durante la gestación, presentando una sensibilidad entre 85-90%, con una tasa de falsos positivo del 5% (2).  

Está estrategia, ha estado destinada principalmente a la detección de las principales aneuploidías (alteración del número de cromosomas) como, por ejemplo: 

• Trisomía del Cromosoma 21: Síndrome de Down; 

• Trisomía del Cromosoma 13: Síndrome de Patau; 

• Trisomía del Cromosoma 18: Síndrome de Edwards.

¿Cómo se realiza el NIPT?

El NIPT se introdujo en la práctica clínica en 2011, principalmente en laboratorios privados, donde el uso del ADN fetal libre circulante (cfDNA) se ha convertido en una realidad en la rutina prenatal y su uso se ha ido ampliando cada vez más (3). 

El cfDNA consiste en fragmentos cortos de ADN que provienen, en su mayoría, de células trofoblásticas de la placenta. El porcentaje de cfDNA derivado del trofoblasto se llama “fracción fetal”, siendo el valor medio a las 10 semanas de gestación de aproximadamente un 10% (4-5). 

Después de la separación del cfDNA de las células maternas, se secuencia y analiza para verificar la cantidad relativa de cromosomas específicos. La comparación se hace con un perfil genético de referencia para identificar posibles alteraciones en el número de cromosomas, como trisomías o monosomías, ya que debemos tener dos cromosomas de cada par homólogo.  

En los últimos años, varios estudios han demostrado la aplicabilidad clínica del NIPT, principalmente en las trisomías más comunes, trisomías de los cromosomas 13, 18 y 21, y aneuploidías de los cromosomas sexuales (6).  

Actualmente, el NIPT se puede utilizar para el tamizaje de aneuploidías en todos los cromosomas, variaciones en el número de copias (CNVs) y en la investigación de enfermedades monogénicas. Sin embargo, cabe señalar que las pruebas NIPT constituyen pruebas de tamizaje y, frente a un resultado positivo, debe confirmarse mediante un examen invasivo, como la amniocentesis. 

Frecuencia de las principales microdeleciones/duplicaciones

Las variaciones en el número de copias (CNVs) patogénicas afectan aproximadamente al 1,7% de los embarazos con hallazgos normales y presentan mayor incidencia en pacientes más jóvenes que las trisomías (7).  

Por lo tanto, los paneles de NIPT se ampliaron inicialmente para la búsqueda de los principales síndromes de microdeleciones, como el síndrome de DiGeorge, síndrome de Cri-du-Chat, síndromes de Prader-Willi/Angelman, deleción 1p36, síndrome de Jacobson y síndrome de Wolf-Hirschhorn. Sin embargo, existen más de 2100 CNVs descritas, la mayoría extremadamente raras e incluso no detectables mediante esta técnica, debido a su pequeño tamaño (8). 

Entienda cómo funciona el neoBona®

El neoBona® es una prueba prenatal no invasiva que permite la detección de alteraciones cromosómicas fetales a partir de la muestra de sangre materna. Presenta tasas de sensibilidad y especificidad superiores a las pruebas de detección del primer trimestre convencionales, con valores superiores al 99%.  

Además, tiene una tasa de falsos positivos inferior al 0,1%, reduciendo significativamente la necesidad de procedimientos invasivos innecesarios que podrían afectar la seguridad del paciente. 

¿Qué es neoBona® GenomeWide? 

Con el creciente avance de las pruebas de detección prenatal no invasivas, SYNLAB pone a disposición la prueba neoBona® GenomeWide, que consiste en el análisis de todos los cromosomas autosómicos (1-22), aneuploidías de cromosomas sexuales (X,Y) y CNVs de más de 7 Mb. La prueba, permitire una detección prenatal ampliada, además de poder realizarse en embarazos concebidos por fertilización in vitro y en embarazos gemelares.  

En casos de embarazos gemelares, no es posible realizar el análisis de aneuploidías en los cromosomas sexuales (X,Y). En caso de detección de la presencia del cromosoma Y, así como de alto riesgo para alguna aneuploidía, se sabe que al menos uno de los fetos posee el resultado respectivo. 

¿Cómo se realiza el neoBona Genomewide?

La prueba neoBona GenomeWide se basa en la tecnología de secuenciación de cfDNA paired-end, que permite determinar la longitud de los fragmentos de ADN libre de manera rápida y eficiente en comparación con los análisis single-end, aumentando así su precisión.

La mayoría de los fragmentos de ADN libre fetal son más cortos que los fragmentos de ADN libre materno; de esta forma, la tecnología permite diferenciar entre los dos, ya que el análisis también utiliza un algoritmo computacional que se enfoca en el análisis de los fragmentos cortos (principalmente fetal) y proporciona un doble análisis de los datos de conteo de cromosomas, generando el T-SCORE (cálculo de puntuación de trisomía única), que integra varios parámetros para proporcionar resultados confiables, mejorando la sensibilidad y especificidad, incluso cuando la fracción fetal es baja. Esto minimiza el número de procedimientos invasivos realizados.  

El T-SCORE toma en cuenta el conteo de cromosomas, la fracción fetal, la determinación de la distribución del tamaño del fragmento y la profundidad de la secuenciación, cuantificando así la probabilidad de trisomía fetal. 

A sensibilidade geral do neoBona GenomeWide é superior a 99% para as síndromes de Down, Edwards e Patau (2). 

¿Para quién está indicado? 

La prueba neoBona GenomeWide está indicada para mujeres embarazadas con al menos 10 semanas gestacionales (≥10+0/7), en las siguientes situaciones: 

• Embarazos únicos o gemelares; 

• Embarazos por FIV; 

• Donación de gametos; 

• Gemelos reabsorbidos; 

• Indicación médica de NIPT ampliado con CNVs a partir de 7 Mb.

¿Cuál es la diferencia del examen ofrecido por SYNLAB?

Considerando que la prueba prenatal no invasiva constituye una prueba de cribado y la alta sensibilidad comprobada en los diferentes estudios, ante un resultado positivo, SYNLAB ofrece gratuitamente la prueba confirmatoria para las trisomías en los cromosomas 13, 18 y 21, XY por QF-PCR y por CGH array para las CNVs detectadas. 

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Referencias Bibliográficas

1. Liao GjW, Gronowski AM, Zhao Z. Non-invasive prenatal testing using cell-free fetal DNA in maternal circulation. Clin Chim Acta. 2014 Jan 20:428:44-50.

2. Cirigliano V, Ordoñez E, Rueda L, Syngelaki A, Nicolaides KH. Performance of the neoBona test: a new paired-end massively parallel shotgun sequencing approach for cell-free DNA-based aneuploidy screening. Ultrasound Obstet Gynecol. 2017 Apr;49(4):460-464.

3. Lo Y.M., et al. Presence of fetal DNA in maternal plasma and serum. Lancet. 1997;350(9076):485–7.

4. Alberry M, Maddocks D, Jones M, et al. Free fetal DNA in maternal plasma in anembryonic pregnancies: Confirmation that the origin is the trophoblast. Prenat Diagn 2007;27(5):415–18.

5. Kinnings SL, Geis JA, Almasri E, et al. Factors affecting levels of circulating cell-free fetal DNA in maternal plasma and their implications for noninvasive prenatal testing. Prenat Diagn 2015;35(8):816–22.

6. Taylor-Phillips S., et al. Accuracy of non-invasive prenatal testing using cell-free DNA for detection of Down, Edwards and Patau syndromes: a systematic review and meta-analysis. BMJ Open. 2016;6(1) p. e010002.

7. Wapner R.J., Levy B. The impact of new genomic technologies in reproductive medicine. Discov Med. 2014;17(96):313–8.

8. Suciu I.D., et al. Non-Invasive Prenatal Testing beyond Trisomies. J Med Life. 2019 Jul-Sep; 12(3): 221–224. doi: 10.25122/jml-2019-0053.